Кишечные бактерии обладают способностью метаболизировать различные субстраты (лактулозу, глюкозу и т. д.), производя водород и/или метан. Эти газы, попадая в легочные альвеолы через кровоток, выделяются с выдыхаемым воздухом и таким образом могут быть измерены с помощью этого устройства. Это позволяет косвенно определить избыток бактерий в кишечнике, оценить непереносимость определенных потребляемых субстратов и измерить время прохождения пищи от рта до слепой кишки.

Тесты выдыхаемого воздуха полезны для оценки ферментативного профиля кишечника у пациентов с вздутием живота, газами, повторяющимися болями в животе, хроническим поносом или запором. Они также используются у пациентов с розацеа, жировой дистрофией печени, метаболическим синдромом или дивертикулярной болезнью толстой кишки.